快捷的消毒区/室消毒区亦称供应室，负责口腔诊所各种器材的清洗、打包、消毒，以供各诊疗室使用。空间的设计，要为消毒隔离、防止交叉感染(crossinfection)创造良好的条件。口腔诊所是病人活动的场所，医疗废弃物、污水、污物、手术切除组织器官等均需要有良好及标准的处置方式。其建筑及室内布局应依照卫生部的相关规定与要求。灭菌和再供给区是临床工作终端的中心，将这块地区放置在中心地带，可充分地装备这两个区域并使其可以消毒和再存储所有的器械。
假如准备创建一个大于10个牙科椅位的大型口腔诊所，不要考虑将消毒区的位置分散在多个地方，而是应该将消毒区放在另一种是设在诊疗室的套间里，消毒室的使用面积一般为8~10m²，其消毒物品可供10台口腔综合治疗台使用。消毒室内应安装换气、排尘装置，以保持室内清洁。室内要有水源和下水道，电源功率要在30kW以上。同时应注意消毒室的采光，因为有些小敷料的制作和配制药液要在此完成。在消毒中费用节省的方法就是一个员工多久开动消毒循环一次。而不是每个单独的设备功能有多快。因此，效率最高的设备在达到最快速度时使器械返回到治疗区的时间很少快过一个组织良好的、高效的消毒中心。拥有一个正确的布局，使用起来顺手、持久，才是消毒中心购买的关键部分。
在最佳的口腔诊所设计中，消毒区的细节是非常关键的，被推荐使用的消毒设备，一般是较快和有较高效率的。口腔诊所最常采用的消毒器械及手机的方法为高温高压消毒锅(autoclave)法及化学药物浸泡法。消毒灭菌有高压蒸气消毒、煮沸消毒、气熏消毒、干热消毒和化学药液浸泡消毒等方法。对于所排出的蒸气宜适当排放，以免破坏周围设备。放置化学消毒水的消毒盒，亦应排列整齐，分门别类，并应填写消毒剂更新日期或有效日期，以确保消毒效果。对于小型口腔诊所则不应该浪费钱去预设一个消毒中心，如果这些中心过于紧凑，也不能够做到聘请全职消毒助手，则无法提供一个好的成本利润比率环境。银汞合金是修补牙体缺损的重要材料，在调和过程中，有一定的汞蒸气散发，故调和银汞合金应在专设的场所进行，室内还应设有排气装备，以尽量减少室内的汞气。
如无条件设置专室，则应在密封罩内进行调和与操作。若能选用银汞胶囊，则汞气泄漏就会较小。
(1)消毒室的设计标准：污染物与非污染物必须分隔；一次性用品使用后应进行初步消毒处理，然后再送往专门部门回收。
(2)手机及器械的消毒设备：包括清洗机、养护性注油机、安装封口机、高温高压灭菌器等。
(3)消毒室的环境：应采光明亮，安装换气、排尘、空气灭菌等装置，室内设有水池和下水道，下水道应与污水处理站接通。
